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该研究创新性地构建了 CRISPR/Cas13a 反式切割驱动的可编程自主合成功能 G - 四链体检测体系,实现了 circRNAs 的无逆转录、一步法、超灵敏定量分析,为 circRNA 相关分子诊断与临床转化研究提供了全新技术路径,有望推动肿瘤早期诊断等精准医学领域的发展。
研究团队引入由上海惠诚生物科技有限公司(Huicheng Biotechnology Co. Ltd.)提供的 Leptotrichia buccalis 来源 Cas13a(LbuCas13a)蛋白,构建了高效特异的 RNA 检测平台。Cas13a 作为 VI 型 CRISPR/Cas 系统中独特的 RNA 靶向效应蛋白,具备序列可编程识别和高效反式切割双重特性。在该检测体系中,Cas13a 与特异性向导 RNA(crRNA)形成复合物,通过 crRNA 的间隔区与 circRNA 的反向剪接位点(BSJ)精准互补配对,实现对靶标 circRNA 的特异性识别。
激活后的 Cas13a 展现出高效的分子操作能力,启动级联反应实现信号指数级放大:
1. 特异性识别与反式切割:Cas13a/crRNA 复合物识别靶标 circRNA 后激活反式切割活性,高效切割含尿嘧啶核糖核苷酸(rU)的底物探针,释放带有 2′,3′- 环磷酸基团的触发序列;
2. 触发序列修复与级联扩增:T4 多核苷酸激酶(T4 PNK)修复触发序列的 3′端结构,启动引物交换反应(PER)级联,通过 Bst DNA 聚合酶的链置换活性,自主合成大量不同长度的功能型 G - 四链体序列;
3. 高信噪比信号报告:荧光染料硫代黄素 T(ThT)与 G - 四链体特异性结合形成稳定复合物,释放强荧光信号,实现靶标 circRNA 的可视化定量。
该体系巧妙整合了 Cas13a 的高保真识别特性(单碱基分辨率)、PER 级联的高效扩增能力(信号放大倍数显著)以及 G - 四链体 / ThT 复合物的高信噪比优势,从识别、扩增到报告形成闭环,彻底解决了传统 circRNA 检测方法灵敏度低、背景高、操作复杂等难题。
该检测技术展现出多项核心优势:
· 超灵敏检测:检测限低至 0.83 aM(10⁻¹⁸ M),较传统方法提升数个数量级;
· 高特异性:凭借 Cas13a 的精准识别和 crRNA 的可编程设计,可区分单碱基错配的 circRNA 变体,抗干扰能力强;
· 简便快速:37℃等温条件下一步法完成检测,全程仅需 40 分钟,无需复杂仪器;
· 广泛适用性:实现单细胞水平内源 circRNA profiling,成功区分乳腺癌组织与健康组织中 circRNA 表达差异,临床样本检测灵敏度和特异性均达 100%;
· 可扩展性强:通过修改 crRNA 的间隔区序列,可快速适配 circMTO1 等其他 circRNA,以及 lncRNA、miRNA 等多种 RNA 标志物检测。
作为该研究关键材料 LbuCas13a 蛋白的供应商,上海惠诚生物科技有限公司始终以 “惠质产品,挚诚服务” 为宗旨,为科研团队提供高品质的 CRISPR/Cas 工具蛋白及配套试剂。公司凭借完善的研发体系和生产布局,为国内基因编辑与分子诊断领域的创新研究提供了可靠的技术支撑,助力科研成果快速转化。

该研究首次实现了 CRISPR/Cas13a 与 PER 级联反应的创新性整合,建立了无需逆转录、无标记、一步法的 circRNA 超灵敏检测技术,不仅填补了 circRNA 精准检测技术的空白,也为循环 RNA 标志物的临床应用提供了标准化解决方案。该技术在肿瘤早期筛查、个体化治疗监测、资源有限环境下的现场分子诊断等场景中具有重要应用价值,将有力推动精准医学检测技术的跨越式发展。
· 其他关键试剂包括 T4 多核苷酸激酶、Bst DNA 聚合酶(大片段)、dNTPs、ThT 荧光染料等,分别购自 New England Biolabs、Sigma-Aldrich 等知名供应商,确保实验结果的稳定性与可靠性。
Cas蛋白系列产品:
E-002 重组CRISPR-Cas12a蛋白(Lb) Crispr 核酸酶 Lbcas12a
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