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Cat. Number
EH04701
Chemical Name
EH04701 核酸外切酶 III Exonuclease III
Qty 1
5000U
Qty 2
25000U
References

核酸外切酶 III Exonuclease III来源于大肠杆菌,是一个由四条相同的多肽链组成的环状四聚体,每个单链约包含310个氨基酸,属于III型外切酶家族。Exonuclease III是一种重要的单链DNA外切酶,可高效和序列特异性的切除DNA单链的5'端核苷酸。Exonuclease III可用于DNA的定性和定量分析、DNA-蛋白质相互作用的研究以及染色体结构的分析等。在RPA技术中使用Exonuclease III,可以有效减少非特异性扩增、提高检出灵敏度、加快反应速度、改善产物检测和减少引物二聚化等。Exonuclease III的加入可以产生协同作用,优化RPA反应,实现更快速、更灵敏和更专一的等温扩增,提高RPA技术的性能,拓展其应用范围。  


规格参数:

货号:EH04701 

规格:5000U/25000U     

为工业客户提供n*25000U。


质量控制:

纯      度: 经高效液相色谱(SEC-HPLC)和SDS-PAGE检测,纯度大于95%.

 

使用说明:

长期储存于-80℃,首次使用后保存于-20℃,避免反复冻融。


核酸外切酶 III 产品特点:

1. Exonuclease III 包含两个结合部位:

内切位点:与DNA杂交,定位切割位点;

外切位点:负责将磷酸基团从DNA磷酸主链上切除。

2. 单链特异性

Exonuclease III只可作用在DNA的单链区域,双链DNA区域不具有活性,这使其成为研究双链DNA解旋及DNA-蛋白质相互作用的重要工具。

3. 依赖性

Exonuclease III的活性依赖Mg2+或Mn2+,并受到溶液的pH值影响,最适作用pH为7.6。高浓度的NaCl可抑制其活性。

4. 切割效率

在最适条件下,Exonuclease III的切割速度为每秒500-1000个磷酸基团,切割效率较高。


核酸外切酶 III 催化机制:

1. 与DNA的5'端结合,内切位点识别切割位点;

2. 外切位点将第一个5'端的磷酸基团从DNA磷酸主链上切除,释放5'-磷酸单核苷酸;

3. Exonuclease III沿着DNA链移向3'端,重复步骤b,依序切除核苷酸;

4. 当遇到双链DNA区域或某些DNA修饰时,酶失去活性,终止切割。


核酸外切酶 III Exonuclease III主要应用如下:

1. DNA序列分析

使用Exonuclease III对单链DNA进行定向切割,分离切割产物,并通过测序分析其序列,这是一种简单有效的DNA序列分析方法。

2. 基因型分析

设计特异引物用于PCR扩增,然后使用Exonuclease III切割未连接的单链DNA,保留双链DNA。测序分析双链DNA可实现基因型的准确分析。 

3. DNA修饰检测

某些DNA修饰如甲基化可抑制Exonuclease III的活性,利用这一特点,可通过Exonuclease III切割检测DNA的修饰状态。

4. DNA多态性分析

Exonuclease III可用于切割单链DNA,分离并测序不同等位基因,实现DNA Sequence Variation的精确分析。

5. DNA损伤检测

DNA损伤会阻碍Exonuclease III切割,利用这一特性,可通过比较Exonuclease III切割效率判断DNA是否存在损伤。

6. DNA-蛋白质相互作用

Exonuclease III切割受DNA结合蛋白的影响,可用于标定DNA与蛋白质的结合位点及研究结合机理。

7. 核苷酸切除测定

使用放射性标记的DNA进行Exonuclease III切割,通过测量释放的放射性核苷酸定量切除效率,来研究影响Exonuclease III活性的因素。  

8. DNA解旋测定

将Exonuclease III用于双链DNA,通过比对双链区域和单链区域的切割情况来判断DNA的解旋状态,研究DNA的二级结构。

9. 核型分析

Exonuclease III可用于切割整个染色体DNA,产生特定长度的DNA片段,通过电泳分离并制作核型,实现遗传学分析。 


核酸外切酶 III Exonuclease III在RPA技术中应用:

1. 降低非特异性产物

RPA反应在一定条件下可能产生非特异性扩增产物,Exonuclease III可以选择性地降解这些非特异性产物的3'单链末端,减少其浓度,提高RPA产物的纯度和专一性。

2. 提高检出灵敏度

Exonuclease III可以降解未结合引物的单链DNA,但不会降解已与引物结合的特异性产物。这可以有效减少反应底物,提高特异性扩增产物的相对浓度,提高RPA的检出灵敏度。

3. 加快反应速度

Exonuclease III通过降解未结合引物的单链DNA,可以减少反应中的底物竞争,使更多的引物和DNA聚合酶结合到特异性的扩增区域,加快RPA的反应速度。

4. 改善产物检测

Exonuclease III降解RPA反应中的游离DNA后可以产生更纯净的特异性扩增产物,易于后续的电泳、测序分析等检测,有利于RPA产物的分析和鉴定。

5. 减少引物二聚化

部分引物在RPA反应条件下可能发生二聚化,影响其与模板DNA的结合。Exonuclease III可以降解这些引物二聚体,使更多的引物与模板DNA结合,提高RPA的扩增效率。


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